全线共有11个站点
记者了解到，宁杭城际铁路走向起自南京南站，沿宁杭高速公路西侧向南，跨上坊互通后在江宁大学城南京医科大学东侧设上坊站，经卧龙湖风景区东侧，跨在建宁常高速公路，在溧水县城东设溧水站。
出站后，线路向东南，在溧阳市上兴镇东北设上兴站。随后沿宁杭高速公路东侧向东南，跨南河、中河、在建杨溧高速公路，于溧阳市南设溧阳站。
向南跨宁杭高速公路，沿宁杭高速公路西侧进入宜兴市，经宜兴森林公园南麓，跨新长铁路及104国道，在龙背山南设新宜兴站。
随后，线路南折经丁蜀镇，西绕白泥场煤矿采空区后两跨新长铁路进入浙江省长兴市，在长兴市东设新长兴站。出站后跨申苏浙皖高速公路、104国道、宁杭高速公路，绕避敢山煤矿采空区，跨长兴港、西苕溪引入既有湖州南站并站。
然后，线路继续向南，经埭溪进入德清县，向南在德清新城区东设德清站，出站后向南经下渚湖湿地保护区东侧，跨东苕溪，经余杭区西侧，跨京杭大运河，经崇贤镇，跨绕城高速公路，并行既有宣杭线经杭州北站，引入杭州东站。
该条线路全长约249公里。其中，江苏境内约147公里，浙江境内约102公里。
到宁波当日可往返
目前，从南京到杭州大部分列车运行的时间都在5至8小时之间，最快的南京至杭州的D471次也要4个小时的时间。与铁路相比，目前公路客运的优势比较明显。现在从南京坐长途汽车到杭州方便许多，并且一趟耗时仅为3个半小时。
记者了解到，宁杭城际铁路正线为双线客运专线，由电力动车组牵引，开通时速每小时300公里。等到2011年年底通车后，从南京坐火车到杭州最快不足1小时。
宁杭城际铁路的开工建设，除了方便南京和杭州两地居民的出行，还可以促进宁波与南京的交流。
随着沪杭甬客运专线杭甬段的建设，从南京到宁波的时间也将大大缩短，将由7至10小时缩短为2小时，宁甬两地的市民可以实现当日往返。
形成1-2小时交通圈
目前，沪宁城际铁路正在紧张建设中，沪杭城际铁路也正式动工。等到两条客运专线建成通车后，从南京到上海和南京到杭州的时间均在1小时左右，极大地方便了各地市民的出行。
记者了解到，宁杭城际铁路是长三角城际快速客运网的组成部分。
根据规划，长三角将形成以上海、南京、杭州为中心的“1—2小时交通圈”。长三角16个城市中任意两个城市之间4小时可以到达。届时，每一个城市都是“网格”上的节点，到长三角各个城市坐火车就像乘公交一样快捷。
